「バジリスク甲賀忍法帖」は、山田風太郎の原作をアニメ化した作品で、甲賀と伊賀の二大忍者集団が世継ぎ問題の決着をつけるために戦う忍法殺戮合戦を描いています。甲賀の弦之介と伊賀の朧は、四百年の宿怨を断ち切り共に生きることを誓いますが、愛し合う二人は殺し合う運命に立たされます。個性豊かな忍者たちが秘術を駆使し、凄惨な戦いを繰り広げます。勝つのは甲賀か、伊賀か？そして、生き残るのは誰なのか？引き裂かれた二人の愛の行方は？