「シェイズ・オブ・ブルー ブルックリン警察」は、賄賂を受け取り軽犯罪を見逃すブルックリン警察と、不正を許さないFBIの争いを描く潜入捜査サスペンス。主人公はシングルマザーの女性刑事ハーリー。彼女はFBIの罠にかかり、自身のチームをスパイするよう強制される。刑務所に送られるか、10年来の恩人でチームを“家族”と考えるウォズを裏切るか、ハーリーは選択を迫られる。同時に、チームの新人刑事が無実の若者を射殺するミスをし、ハーリーは正当防衛に見せかけようと偽装を手伝うが、内部調査で追及を受ける。