「Six アメリカ海軍特殊部隊」は、元シール・チーム6の隊長リップがナイジェリアの過激派組織「ボコ・ハラム」に誘拐される事件を描く。リップは過去の過ちからテロ組織の男マイケルに恨まれ、彼もまたリップを追い詰める。一方、残された隊員たちはリップの救出に向かう。アフガニスタンでの任務中の殺害が原因で退役したリップの過去が明らかになり、三つ巴の戦いが繰り広げられる。