"ロキ"は、アベンジャーズから逃げ出した後、時空を歪めた罪により、謎の組織TVAに拘束される。自由の身になるため、彼は現実を元に戻し、世界の時間を修復するミッションに挑む。TVAエージェントのメビウスとタッグを組み、タイムトラベルを使って重大な事件の歴史を変え、世界の時間を修復する。しかし、その過程で人類の歴史に隠された重大な謎が明かされる。また、彼は"虚無空間"と呼ばれる荒涼とした場所から脱出しようとするが、そこで自分の変異体に出会う。