「ウルトラマンネクサス」は、レスキュー隊員の孤門一輝が非公然防衛組織TLTに配属され、謎の怪物ペドレオンと遭遇する物語。孤門が諦めかけた時、赤い光から銀色の巨人ウルトラマンが現れ、怪物を倒し孤門を救う。その後、孤門はTLTの実働攻撃部隊ナイトレイダーへ入隊し、人々の記憶を消す組織のやり方に困惑しながらも、ウルトラマンネクサスを信じて戦い続ける。ハードSF的世界観で展開される異色のウルトラシリーズ。