アンデッドの街と化したラクーンシティで、アリスは生存者のジルたちと行動をともにしていた。そこへ、全ての元凶T-ウイルスを発明したアシュフォード博士から電話が入る。彼は街に核爆弾が投下されると告げ脱出を手引きする代わりに、娘の救出を要求する。最悪の結末まであとわずか。果たして彼らは、無事に生き残ることができるのか?

"バイオハザード アポカリプス"は、アンデッドの街ラクーンシティでアリスと生存者ジルたちが行動を共にする物語。全ての元凶T-ウイルスを発明したアシュフォード博士からの電話により、核爆弾の投下と娘の救出を知る。さらに、追跡者“ネメシス”の存在も明らかになる。最悪の結末まであとわずか、彼らは無事に生き残れるのか、その結末が描かれている。