現代日本において、除霊はボロいビジネスになった。社会の安全と経済活動を脅かす悪霊や妖怪を退治する現代のエクソシスト、それがＧＳ（ゴーストスイーパー）。ＧＳの仕事には巨額のギャラが発生する。例えば巨大オフィスビルに住み着いた悪霊を退治して「悪霊からの地上げ」を 成功させれば、何億ものギャラが転がり込むのだ。美神令子は、そんな花形職業の中でも実力も超一流ならギャラも超一流という美人ゴーストスイーパー。パートナーをつとめるのは、彼女の色香に迷って時給250円という超安いギャラでバイトをしている横島くんと、お祓いしてもらって成仏するため、日給30円のギャラを貯めている300年前の娘の幽霊・おキヌちゃんだ。妖怪、悪魔、悪霊たちを様々な特殊アイテムを使って、退治したり時には成仏させたり。美神は今日もギャラを稼ぎまくる！(C)椎名高志・小学館／東映アニメーション

「ゴーストスイーパー美神」は、現代日本で除霊がビジネスと化した世界を描く。主人公の美神令子は、悪霊や妖怪を退治するエクソシストで、その実力と美貌から超一流のギャラを稼ぐ美人ゴーストスイーパー。彼女のパートナーは、自給250円の横島くんと日給30円を貯める幽霊のおキヌちゃん。彼らと共に、美神は様々な特殊アイテムを使い、妖怪や悪霊を退治し、時には成仏させてギャラを稼ぎまくる。商売敵や特殊能力を持つ箱入り娘GS等が絡む中、コミカルなアクションやギャグが展開される。