「機甲戦記ドラグナー」は、西暦2087年の月に本拠を置く「統一帝国ギガノス」が地球に宣戦布告した世界を描く。中立のスペースコロニー「アルカード」で暮らす青年ケーンは、偶然にもD兵器「ドラグナー」の搭乗員となり、ギガノスと戦うことに。一方、地球連合軍はギガノスからの亡命科学者の手引きで「ドラグナー」シリーズ3機を奪取。しかし、ドラグナーを運ぶ宇宙船が攻撃に遭い、ケーンたちは戦火に巻き込まれる。彼らはドラグナーを発見し、ギガノス軍を追い払おうとするが、アルカードは大破。ケーンは母を助けようとするが、爆発で近付けなくなる。