３姉妹をめぐって、コブラとクリスタルボーイが激突。賞金稼ぎのジェーンは、自分に言い寄ってきた男が海賊コブラだと知り、用心棒を依頼。目的は、彼女の３つ子の姉妹キャサリンとドミニクを探すことだった。コブラはジェーンと共に、クリスタルボーイに監禁されているキャサリンを救出に向かう。だが、クリスタルボーイの命令に忠実なキャサリンは、ジェーンを裏切る。コブラはジェーンの残したメッセージに従って、ドミニクに会いに行く。だが、そこへも大軍団を引き連れたクリスタルボーイが現れた！

「スペースアドベンチャー コブラ」は、賞金稼ぎのジェーンと海賊コブラの冒険を描いた作品。ジェーンは、自分に言い寄ってきた男が賞金首のコブラだと知り、生き別れた３つ子の姉妹キャサリンとドミニクを探すために彼に協力を依頼する。コブラとジェーンは、クリスタルボーイに監禁されているキャサリンを救出に向かうが、クリスタルボーイを愛するキャサリンはジェーンを裏切る。その後、ジェーンの残したメッセージに従ってドミニクに会いに行くコブラの前に、大軍団を引き連れたクリスタルボーイが再び現れる。