上流階級の家柄のボンボンや令嬢ばかりが通う私立桜蘭学院高等部1年の藤岡ハルヒは、一般市民であるにもかかわらず特待生として入学する。ある日、静かに勉強できる場所を探していると第三音楽室にたどり着く。扉を開けるとそこには、「暇を持て余す美少年が、同じく暇をもて余す女子生徒をもてなし潤す」ホスト部の集団が…。そこでハルヒは高価な花瓶を割ってしまい、弁償金800万円を払う代わりにホスト部の雑用係となる。しかし美しい顔立ちゆえにすぐに格上げとなり接客係に。100人のノルマを課せられホスト部員として動き出したハルヒだが、実は...ハルヒは女の子だった？！