"WOLF'S RAIN"は、絶滅したとされる狼たちが人間の姿に変わり、生き延びる物語。主人公キバは、狼だけが許された世界「楽園」へ導く「月の花」の匂いを追い求め、ツメ、ヒゲ、トオボエといった狼の仲間たちと共に荒廃した世界を旅する。途中で貴族が作り出した「花の少女・チェザ」に出会い、彼女もまた楽園への鍵となる。一方で、チェザの研究に没頭するシェール、元夫のハブ、狼に復讐を誓うクエント元保安官、そして謎の貴族ダルシア三世もまた、それぞれの思惑でキバたちと交錯する。