観光名所となったお台場を管轄とする湾岸署では今日も観光案内や迷子などに対応する日々が続いていた。 そんなある日、湾岸署の管轄内で会社員が被害者となった猟奇的な殺人事件が起こる。殺人事件に際して湾岸署に捜査本部が設置されるが、その指揮を取るのは初の女性管理官である沖田仁美警視正であり、室井慎次警視正は捜査副本部となった。しかし、捜査は難航し、その間に第2の殺人でまたも会社員が犠牲となり、室井はその責任を取らされる形となる。 縦割り行政によって思うように動けない中で青島たちはどう事件を解決していくのか。

「踊る大捜査線 THE MOVIE 2 レインボーブリッジを封鎖せよ!」は、お台場を舞台に進化した捜査と犯罪が繰り広げられる劇場版第2弾です。人気テレビドラマシリーズからおなじみのメンバーに加え、真矢みきら新たな顔ぶれが加わり、最新型の捜査が展開されます。また、この作品はいかりや長介のシリーズ最後の出演作となります。5年の時を経て、更に進化したストーリーとキャラクターが観客を引きつけます。