フリントが発明した「食べ物マシン」による大騒動も収まり、町は平和になった。ところが再びマシンが動き出し、食べ物と動物が合体したフード・アニマルに町が占拠されてしまう。フリントと仲間たちはまたも危険な戦いに挑むことになり…。

「くもりときどきミートボール2 フード・アニマル誕生の秘密」は、食べ物マシンが再び暴走し、奇想天外な冒険が繰り広げられるCGアニメの続編です。今回は、マンゴーとフラミンゴ、タコスとワニなど、食べ物と動物が合体した奇妙な生物たちが多数登場します。その個性的な姿に、主人公のフリントと視聴者が一緒に大騒ぎしながら見るのが楽しいポイントです。新たな冒険と共に、笑いと驚きの連続が待っています。