突如出現した人類の敵ネウロイ。対抗できるのは「ウィッチ」と呼ばれる特殊な力を持った少女だけだった。第501統合戦闘航空団ストライクウィッチーズの活躍で戦線が変化、反抗作戦が計画され第502統合戦闘航空団ブレイブウィッチーズにも出撃命令が下される。

「ブレイブウィッチーズ」は、「ストライクウィッチーズ」のTVアニメ第3弾で、空を飛ぶ魔法少女たちの活躍を描いています。脚部に装着したメカを使い、天を駆ける彼女たちは、突如として出現した人類の敵に果敢に挑みます。その戦いの中で、「戦いたければ強くなれ」というメッセージが込められています。人気アクションシリーズの第3弾として、魔法少女たちの新たな戦いが描かれています。