しゃべる犬のシャーロや助手のノアと共にロンドンで探偵社を営むレイトン教授の娘・カトリー。突如姿を消した父親を探すために始めた仕事だったが、その奇想天外な謎解きが話題となり、さまざまな事件が舞い込んでくる。今日も新たな調査の依頼があり…。

「レイトン ミステリー探偵社 ～カトリーのナゾトキファイル～」は、大人気推理アドベンチャーゲーム「レイトン」シリーズをアニメ化した作品です。物語の主人公はレイトン教授の娘で、彼女が難事件の数々をキュートかつ華麗に解決していきます。ゲームから始まり、幅広いメディアで人気を博した「レイトン」シリーズの世界を、新たな視点から楽しむことができます。