タソガレドキ忍者・諸泉尊奈門に挑まれた決闘に向かった後、消息を絶ってしまった土井先生―尊奈門とその上司にあたる雑渡昆奈門から一連の事情を聞いた、忍術学園の山田先生と六年生たちは土井先生の捜索に当たる。一方、何も知らない一年は組では、昆奈門・尊奈門が土井先生・山田先生の代わりに教壇に立つことに！！異様な緊張感が走る授業にへとへとになりつつも、いつも通りのん気に過ごす一年は組の忍たまたちだったが—

「忍たま乱太郎」史上最強の激闘と絆の物語「劇場版 忍たま乱太郎 ドクタケ忍者隊最強の軍師」がついに劇場で公開！1986年に連載開始された「落第忍者乱太郎」は、1993年からテレビアニメが放送され、幅広い世代に愛されてきました。その中でもファンの間で人気の「小説 落第忍者乱太郎 ドクタケ忍者隊 最強の軍師」が映像化。監督は初代キャラクターデザインを務め、前作「劇場版アニメ 忍たま乱太郎 忍術学園全員出動！の段」も手がけた藤森雅也。脚本は原作の阪口和久が担当。アニメーション制作は亜細亜堂が担当し、高山みなみ、田中真弓、一龍斎貞友、関俊彦ら豪華キャスト陣も集合する。土井先生と忍たまたちの絆で「勇気100%」が流れる日常を取り戻すことができるのか？2024年12月、劇場でしか見られない「忍たま」が幕を開ける。