2001年9月11日、アメリカ同時多発テロが発生。マンハッタンにある超高層ビルに旅客機が突入し、多くの犠牲者を生む。その瓦礫の中に、ある消防隊員が星条旗を立てたのだが、数時間後、何者かによって取り去られてしまった。この星条旗の行方を追う。

「9.11～消えた星条旗を探し出せ～」は、アメリカの象徴である星条旗の行方を追うドキュメンタリーです。9.11テロ事件後、行方不明となったグランド・ゼロに立てられた星条旗の在りかを探すため、司会の小説家ブラッド・メルツァーが国民に情報提供を呼びかけます。星条旗の行方については様々な噂が立っていますが、この番組ではそれらの噂を検証し、真実を解き明かそうとします。視聴者は、アメリカの象徴がどのようにして失われ、そしてどのようにして見つけ出されるのかを追体験します。