ピーターは世界で一番幸せなウサギ。たくさんの仲間に囲まれ、画家のビアという心優しい大親友もいる。亡き両親のことを想うと寂しいけれど、ビアの存在がすべてを吹き飛ばしてくれる。ところがある日、大都会ロンドンから潔癖症で動物嫌いのマグレガーが隣に引っ越してきたことで、ピーターの生活は一変！今までの幸せを守りたいピーターと、あの手この手で動物たちを追い払おうとするマグレガーとの争いはエスカレート。さらにビアへの“恋心”も絡まって思わぬ大事件に発展！ピーターはあるミッションを秘めて、初めてのロンドンへ向かうのだが。

「ピーター・ラビット」は、幸せなウサギ、ピーターの物語。仲間たちと共に暮らし、心優しい画家ビアとの友情に支えられていたが、動物嫌いのマグレガーが隣に引っ越してきて生活が一変。ピーターは自身の幸せを守るため、マグレガーとの争いに巻き込まれる。さらにビアへの恋心も絡み、大事件へと発展。秘密のミッションを抱え、初めてのロンドンへと向かうピーターの冒険が描かれている。