脱税、贈賄、詐欺容疑で逮捕され、取り調べを受けていたはずの花菱物産社長・花菱孝一郎が殺された。花菱からたどって政界の不正を暴こうとしていた地検特捜部は大打撃。そんななか、太郎が国税局の森村を訪れると、そこにかつての自分の部下・赤倉がいた。

「税務調査官　窓際太郎の事件簿 13」は、小林稔侍が演じる税務調査官が政治と金にまつわる黒幕に迫る物語の第13弾です。今回は、政財界のドンが太郎の最大の敵となります。美人で子持ちの税務官をパートナーに、太郎は政財界の不正を暴く証拠を掴むために奮闘します。その過程で、太郎は政財界を敵に回すことになりますが、彼の正義感と緻密な調査力で、事件の真相に迫っていきます。