ごく普通の女子高生の星野愛は、下校途中に何者かに連れ去られる。愛が目を覚ますと、悪の秘密組織・ジョーカーに手術され改造人間となっていた。親友の片桐由美にその事実を相談するが彼女も改造されており、洗脳された由美との戦いを余儀なくされる。

「THE MASKED GIRL 女子高生は改造人間」は、史上最強の女子高生が誕生する物語です。美少女クラブ31の清水由紀と中村静香が、無敵の改造人間となった女子高生を演じます。彼女たちの戦いと友情が描かれる本格的なアクションと、制服のスカートを翻し戦う姿が見どころです。さらに、意外な展開が起こるストーリーにも注目です。美少女たちの強さと絆を描いた、この作品はアクション映画の新たな一面を見せてくれます。