関東最大の組織・坂東睦連合会会長・武田がヒットマンに狙われ、意識不明の重体に。理事長の真壁は、その跡目を継ぎ、関西最大組織・天満会の関東進出の後押しを企んでいた。その動きを知った榎本組組長・榎本は、若頭の樋口に動向を探らせるのだが…。

「首都抗争3」は、関東のヤクザが関西勢力に飲み込まれる危機を描いた任侠ドラマシリーズの第3弾です。関東と関西のヤクザ間で一触即発の緊張が高まる中、跡目を巡る内部での争いが勃発します。裏切り者の思惑が絡み、本宮泰風が怒りに震える様子など、事態は次第に混迷していきます。最後まで目が離せない展開が待ち受けています。