破門組々長・佐倉恭一は、市原会々長からの依頼で、木更津を根城に暴れるギャングを叩きのめす。しかし、ギャングのリーダーは巨大組織・山王会剣崎組々長の実子だった。剣崎組と癒着するチャイニーズマフィアが報復として、破門組四天王を襲撃する。

「破門組2」は、原田龍二主演のヤクザアクション・シリーズの第2弾であり、最終章です。物語は、最凶組織として名高い破門組が、巨大ヤクザ組織、ギャング、チャイニーズマフィアとの戦いに挑むところから始まります。しかし、彼らはこれらの強大な敵に対して苦戦を強いられます。前半部分とは一転して、後半部分は死屍累々となる迫真の格闘戦が展開されます。また、山王会との因縁が再び描かれ、緊張感あふれる展開が続きます。