日本物理学界の大御所・立石博士を乗せた日航機が突然行方不明になった。さらに、次々と船や旅客機が姿を消す。これは、まぼろし大使による所業で、地球上の優れた科学者を銀星の奇巌城に集め、科学者たちに地球が降伏することを促す計画だった。

「遊星王子 恐怖の宇宙船」は、『遊星王子』の続編で、20年後の世界を描いています。再び地球征服を狙うまぼろし大使との戦いが繰り広げられます。日本初の宇宙人を主人公にしたこの作品は、テレビドラマの映画化第2弾で、前作で主演した梅宮辰夫が引き続き主演を務めています。物語は広大な宇宙を舞台に展開し、先鋭的な化学兵器を駆使した戦いが始まります。この作品は、新たな地球征服の野望と、それに立ち向かう遊星王子の活躍を描いています。