悪名高い施設「コロニア・ディグニダ」は独裁者、パウル・シェーファーによって厳格に管理・支配されていた。奨学生としてコロニア・ディグニダの学校に通い始めた12歳の少年・パブロは、入学してすぐに集団を統治するパウル様の“お気に入り”に選ばれる。

「コロニアの子供たち」は、60年代初頭のチリを舞台に、ナチス残党が設立した拷問施設「コロニア・ディグニダ」の実話を描いています。この作品は、施設に入った少年の視点から、その隠された負の歴史を描き出します。規範をもとにした共同体という名の下に、人間の尊厳を踏みにじる恐ろしい実態が存在していたことを、視覚的に伝えています。