荒廃した世界に、ひたすら西に向かって旅を続ける少女がいた。彼女の名前はヤクモ、この地上でただ一人生き残った人間である。300年前、隕石の衝突で都市は廃墟と化し、多くの人々が命を落とした。さらに科学によって作られた新生命体・マトリクサーが反乱を起こし、人類はついに滅亡したのである。そして300年後、コールドスリープの深い眠りから覚めたヤクモが見たのは、マトリクサーの支配する世界だった。だが、西の地にあるという“センター”には、同じ人間の生き残りがいるかもしれない。人類はまだ滅んでいない…ヤクモはそう信じて旅に出る。お供を務めるのは、彼女の優しさに打たれて仲間になった三人のマトリクサーたち。暴れん坊のマシュラ、冷静で知的なサーゴ、大食いで力持ちのクータルだ。旅を妨害しようとするマトリクサーの将軍たちと戦いながら、ヤクモたちは遥かなる約束の場所を目指す！

「マシュランボー」は、300年前の隕石衝突と新生命体マトリクサーの反乱により人類が滅亡した世界を舞台に、唯一生き残った少女ヤクモが人類の生存者を求めて旅をする物語。彼女は、マトリクサーのマシュラ、サーゴ、クータルと共に、西の地「センター」を目指す。彼らはマトリクサーの将軍たちと戦いながら、遥かなる約束の場所を目指す。