とあるドキュメンタリー企画が「ほん呪」制作会社に持ち込まれた。それは、元・「ほん呪」ディレクター菊池を通しての持ち込みであった。企画者は、自らを一ノ瀬と名乗る女性ディレクターで、内容は彼女の知人・永戸佳史さん（仮名）にまつわる奇妙な調査記録であった。永戸さんはかつて妻と娘の3人で暮らしていたが、2年前の8月、車の正面衝突事故により娘のナナさん（仮名）を亡くしてしまった。妻も意識不明で入院する中、精神的に不安定になり新興宗教や占いの類いに縋り没頭するも、その後、失踪を遂げてしまう。しかしなんと、別の場所で永戸さんは「娘と暮らしている」ことが判明する。更に、不可解な現象が収録されたSDカードが、遺書と共に永戸さんの車から見つかった。驚くことにその映像は件の正面衝突事故より後の日付にも関わらず、永戸さんと、既に死亡したはずのナナさんが共に元気な様子で映っている、というのだ。持ち込まれた制作会社のプロデューサーは、興味を示しつつも、通常のドキュメンタリー企画として取り扱うことに難色を示し、一ノ瀬と菊池に対して、ある提案をするのだが……。

25周年を迎えた伝説の心霊ドキュメンタリーシリーズ「劇場版 ほんとにあった！呪いのビデオ109」は、記憶を失った映像ディレクターが謎の降霊師を追う中で、恐るべき霊的現象に巻き込まれていく物語です。視る者の心に棲みつく、忘れられない悪夢は真実か、幻想か。劇場版でさらに深い恐怖を描き出す衝撃作です。