早崎道夫は、医療機器メーカー、メディカル・サイテック社のエリート研究者。彼は10年前に開発した血圧計が大ヒットしたことで、次の開発へ向けて周囲から期待を寄せられている。だが、今では助手と共に人工人体の開発を続けるもはかどらず、上司からもたびたび進捗状況を問われ、ストレスを募らせていた。そんなある日、スランプ状態に陥る早崎の前に突然、彼に瓜二つの外見を持つ分身“ドッペルゲンガー”が出現した。そして、早崎が必死にその存在を否定する中、分身は彼に協力するために現われたと告げるのだった…。

"ドッペルゲンガー"は、エリート研究者早崎道夫とデザイナー永井由佳の物語。早崎は人工人体の開発に苦悩し、その中で自身の分身“ドッペルゲンガー”が現れる。一方、由佳は自殺した弟のドッペルゲンガーと共に生活していた。しかし、早崎のドッペルゲンガーが由佳の弟のドッペルゲンガーを殺害し、その後自身も早崎によって殺される。その後、ロボットを巡る争いが起こり、早崎と由佳は共に闘うことになる。最終的に、二人はロボットを自殺させ、共に新たな道を歩むことを決意する。